Un juego de raqueta y volante aliviaba ocasionalmente sus vigilias; pero ninguna ocupación seria dividía su atención de la ardua tarea que habían emprendido, de dominar y digerir los principios de la teología agustiniana. El obispo de Bayona ofreció un beneficio eclesiástico a D’Hauranne, y hubo proyectos de establecer también a Jansenio al frente de un colegio; pero no fue sino hasta algún tiempo después que ambos emprendieron labores oficiales. Se les dejó durante esos años a los estudios ininterrumpidos que posteriormente resultaron en la gran obra de Jansenio. El sistema de pensamiento teológico asociado a su nombre quedó entonces definitivamente madurado.
Está fuera de nuestro propósito trazar la trayectoria de estos estudiantes compañeros, uno de los cuales se convirtió en el principal director espiritual de Port Royal, y el otro en su gran centro teológico. El abad de St Cyran fue el único beneficio eclesiástico que D’Hauranne aceptó jamás, a pesar de los repetidos ofrecimientos de un obispado por parte de Richelieu. Se conformó con ejercer desde su reclusión monástica una influencia mucho más poderosa que la de cualquier obispo de su época. Y tan penetrante y peligrosa pareció esta influencia al gran Ministro, cuyos esfuerzos por atarlo a su bando habían fracasado tantos veces, que al fin lo encerró en Vincennes (mayo de 1638). Aquí permaneció en estricto encierro durante más de cuatro años; pero incluso desde este sombrío refugio la impresión de su gran poder personal se propagó por todas partes, y se sintió en muchos lugares con tanta firmeza como antes. Sobrevivió a su liberación esencialmente unos pocos meses. Su largo encierro había arruinado su salud; y aunque el entusiasmo de su espíritu era tan fuerte como siempre, su cuerpo debilitado ya no era capaz de responder a sus exigencias. Apenas podía «tenerse en pie», y un leve ataque de enfermedad se lo llevó.