El presidente y sus colegas, por su parte, sostuvieron que era imperativo que todos los procuradores declarasen que tanto perjudicaría a la causa de la religión como a los verdaderos intereses de la corona si Cortés regresaba a la Nueva España, pues su presencia solo crearía facciones y alborotos entre los habitantes, y un buen gobierno sería totalmente impracticable; que además no era improbable que él aprovechara la primera oportunidad para tomar posesión por la fuerza del país y declarase su independencia de la corona española. Estas afirmaciones las negamos rotundamente la mayoría de nosotros, los Conquistadores, y sostuvimos que Su Majestad no tenía servidor más devoto y fiel que Cortés.
Por este tiempo regresó también Alvarado de España, como gobernador y justicia mayor de Guatemala y comendador de Santiago. Le acompañaba su esposa recién casada, doña Francisca de la Cueva, quien, sin embargo, falleció poco después de su llegada a Veracruz, por lo que Alvarado y su séquito llegaron a México vestidos de luto riguroso.
Tan pronto como supo la naturaleza de la petición que los oidores iban a despachar a su majestad, se arregló para que redactáramos una representación conjunta dirigida al emperador, en la cual explicamos detalladamente a su majestad el verdadero propósito que el presidente y sus colegas tenían en mira.
Cuando, por consiguiente, los dos procuradores antes mencionados presentaron sus documentos ante el Consejo de Indias, los miembros de este cuerpo comprendieron fácilmente que no contenían sino un sentimiento rencoroso contra Cortés. Por lo tanto, no se prestó la más mínima atención a estas representaciones y se confirmó el decreto imperial para la destitución de los oidores. Cortés se hallaba aún en España por aquel entonces, y es de suponerse naturalmente que todos estos intentos por perjudicarle redundaron en su beneficio y aumentaron su honra.