Eran demasiados, sin embargo, los que conocían el secreto, y Cortés era un hombre de influencia magnética. A última hora, dos días después del regreso de Xochimilco, cuenta Díaz, un cómplice, asaltado por el remordimiento, corrió desesperado a los pies de Cortés y le imploró perdón por haberse atrevido siquiera a escuchar las viles maquinaciones. Acto seguido reveló la conspiración y afirmó que Villafañe llevaba los nombres y los detalles en una lista en el bolsillo del pecho. Cortés llamó discretamente a sus capitanes. Expuso la necesidad de
un «remedio, puesto que, además del escándalo, era evidente que todos los españoles debían perecer si una vez se volvían los unos contra los otros; y para tal fin no solo los enemigos declarados, sino también los aliados se unirían».47
Acompañado por Sandoval y otros, Cortés se apresuró a ir a la casa del acusado y encontró a varias personas reunidas. Algunas fueron apresadas cuando intentaban huir.
Villafañe tuvo tiempo de sacar un papel de su pecho y romperlo en pedazos, pero Cortés los recogió y juntó,48 y le dolió leer los nombres de un buen número de personas prometedoras a quienes había honrado y tenido por amigos.
Villafañe confesó los detalles de la conspiración, que se venía gestando desde la campaña de Tepeaca. Se celebró un consejo de guerra, presidido por el propio Cortés, y al no haber dudas de su culpabilidad, el acusado fue condenado a muerte y colgado sin demora de la ventana de su vivienda.49