A Sandoval se le asignó el menor número de caballos y el mayor número de aliados, pues los congregados en Chalco tenían órdenes de esperarle, mientras que Alvarado recibió una mitad completa de la fuerza tlascalteca, para quien el Tonatiuh era un gran favorito. A este líder se le asignó Tlacopan como cuartel general; a Olid, Coyuhuacan; y Sandoval recibió órdenes de completar la destrucción de Iztapalapan, para luego avanzar por Coyuhuacan y a lo largo de una de las calzadas del sur, y seleccionar allí su cuartel general, bajo la protección de los bergantines. Estos nombramientos y órdenes sufrieron varios cambios durante el sitio. Cortés se reservó para sí la dirección de la flota, de la que tanto dependía durante el inicio del asedio, y además de las tripulaciones de sus naves, compuestas por tres hombres, contó con el respaldo de varios miles de aliados, principalmente texcocanos bajo el mando de Ixtlilxochitl, quienes concurrieron en un gran número de canoas. Esta elección apenas agradó al ejército, que consideraba que sus operaciones eran las más importantes y peligrosas, y que por lo tanto necesitaban de la supervisión de Cortés. Pero es evidente que este nunca tuvo la intención de permanecer con la flota, excepto al principio.
Al día siguiente, las fuerzas aliadas asignadas a Alvarado y Olid recibieron la orden de marchar por adelantado, para mayor comodidad, hacia la frontera de la provincia de Tezcuco y esperar allí a los españoles. No muchas horas después de su partida, apareció un mensajero con la noticia de que Xicotencatl, el general compañero de Chichimecatl, había desaparecido. Las averiguaciones revelaron que poco antes su primo Piltecuhtli había sido golpeado severamente y sin motivo por un soldado durante una pelea por unos tamemes. Para salvar al soldado de la ira de Cortés, Ojeda, el oficial inspector español de las fuerzas aliadas, restó importancia al asunto y envió al noble herido a su casa. Algunos afirmaban que este ultraje había herido tanto a Xicotencatl que este había seguido a su primo. Otros suponían que ambos jefes estaban enamorados de la misma mujer y que Xicotencatl no podía soportar dejar a su rival