Ahora, apliquemos estos dos principios a las especies en estado de naturaleza.
Tomemos un grupo de aves, descendientes de alguna forma antigua y modificadas mediante la selección natural para diferentes hábitos. Luego, a partir de las muchas y ligeras variaciones sucesivas sobrevenidas en las distintas especies en una época no temprana, y heredadas en una época correspondiente, los jóvenes habrán sido muy poco modificados, y todavía se parecerán entre sí mucho más que los adultos, tal como hemos visto con las razas de palomas.
Podemos extender esta perspectiva a estructuras ampliamente distintas y a clases enteras. Las extremidades anteriores, por ejemplo, que una vez sirvieron como patas a un progenitor remoto, pueden haberse adaptado, a través de un largo curso de modificación, en un descendiente para actuar como manos, en otro como remos, en otro como alas; pero según los dos principios anteriores, las extremidades anteriores no habrán sido muy modificadas en los embriones de estas diversas formas; aunque en cada forma la extremidad anterior diferirá grandemente en el estado adulto.
Cualquier influencia que el uso o desuso prolongado haya tenido en la modificación de las extremidades u otras partes de cualquier especie, habrá afectado a esta principal o únicamente cuando esté próxima a la madurez, cuando se vio obligada a usar todas sus facultades para ganarse la vida; y los efectos así producidos se habrán transmitido a la descendencia en una edad madura correspondiente y similar. Así, los jóvenes no se verán modificados, o solo se verán modificados en un grado ligero, a través de los efectos del uso o desuso incrementado de las partes.
En algunos animales las variaciones sucesivas pueden haber sobrevenido en un período muy temprano de la vida, o los grados pueden haberse heredado a una edad más temprana que aquella en la que ocurrieron por primera vez.